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鑒定克氏原螯蝦TaqMan實時熒光定量PCR的探針引物組合、試劑盒及應(yīng)用

文檔序號:42592160發(fā)布日期:2025-07-29 17:44閱讀:10來源:國知局

本發(fā)明實施例涉及生物檢測,具體涉及一種鑒定克氏原螯蝦taqman實時熒光定量pcr的探針引物組合、試劑盒及應(yīng)用。


背景技術(shù):

1、克氏原螯蝦(procambarus?clarkii),又稱小龍蝦,是一種在全球范圍內(nèi)廣泛分布且具有重要經(jīng)濟價值的甲殼類動物。其肉質(zhì)鮮美,深受消費者喜愛,在水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)中占據(jù)重要地位。隨著克氏原螯蝦養(yǎng)殖規(guī)模的不斷擴大,對其疾病防控、種群監(jiān)測以及品質(zhì)鑒定等方面的精準(zhǔn)檢測需求日益迫切。

2、傳統(tǒng)的克氏原螯蝦檢測方法,如形態(tài)學(xué)鑒定,主要依賴于專業(yè)人員根據(jù)其外觀特征進行判斷,這種方法主觀性強、準(zhǔn)確性低,且對于幼體或形態(tài)相似的物種難以準(zhǔn)確區(qū)分。而基于生化指標(biāo)的檢測方法,操作繁瑣、耗時較長,且靈敏度有限,無法滿足快速、高效檢測的需求。

3、分子生物學(xué)檢測技術(shù)逐漸成為克氏原螯蝦檢測的重要手段。其中,普通pcr技術(shù)雖然能夠?qū)崿F(xiàn)對特定基因的擴增,但存在易污染、無法進行定量分析等缺點。實時熒光定量pcr技術(shù)因其具有靈敏度高、特異性強、可定量分析等優(yōu)勢,在克氏原螯蝦檢測領(lǐng)域具有廣闊的應(yīng)用前景。然而,目前針對克氏原螯蝦的實時熒光定量pcr檢測技術(shù)中,熒光引物組合的特異性和擴增效率參差不齊。部分引物組合特異性不強,容易出現(xiàn)非特異性擴增,導(dǎo)致檢測結(jié)果不準(zhǔn)確;一些引物組合的擴增效率較低,無法滿足90%-110%的范圍要求,影響了檢測的靈敏度和準(zhǔn)確性。


技術(shù)實現(xiàn)思路

1、為此,本發(fā)明實施例提供一種鑒定克氏原螯蝦taqman實時熒光定量pcr的探針引物組合、試劑盒及應(yīng)用。

2、為了實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明實施例提供如下技術(shù)方案:

3、根據(jù)本發(fā)明實施例的第一方面,本發(fā)明提供一種鑒定克氏原螯蝦taqman實時熒光定量pcr的探針引物組合,包括探針,上游引物和下游引物,所述探針的核苷酸序列為:5'-fam-ctttacctgtgttggca-mgb-3',上游引物的核苷酸序列為5'-gctattaatatacgaacagtagggataacc-3',下游引物的核苷酸序列為5'-caaaaaaagaagtatttagattacgatctg-3'。

4、根據(jù)本發(fā)明實施例的第二方面,本發(fā)明提供一種鑒定克氏原螯蝦taqman實時熒光定量pcr的試劑盒,包括如上所述的探針引物組合。

5、根據(jù)本發(fā)明實施例的第三方面,本發(fā)明提供如上所述的探針引物組合,或,如上所述的試劑盒在克氏原螯蝦物種鑒定中的應(yīng)用。

6、根據(jù)本發(fā)明實施例的第四方面,本發(fā)明提供一種克氏原螯蝦物種鑒定方法,所述方法包括:

7、(1)提取待測樣品cdna或者基因組dna;

8、(2)以如上所述的探針、上游引物和下游引物進行taqman實時熒光定量pcr反應(yīng),得到ct值及擴增曲線;

9、(3)檢測結(jié)果判定:ct值≤35,且出現(xiàn)典型的擴增曲線,則結(jié)果為陽性;無ct值或無擴增曲線,結(jié)果為陰性;ct值>35時,重做該樣本,若重做結(jié)果無ct值為陰性,否則為陽性。

10、進一步地,taqman實時熒光定量pcr反應(yīng)體系為:預(yù)混試劑10μl,上游引物10μm0.7μl,下游引物10μm?0.7μl,taqman探針10μm?0.6μl,dna模板1μl,用ddh2o補充至總體積20μl。

11、進一步地,taqman實時熒光定量pcr反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性2min;95℃15s,60℃30s,40個循環(huán)。

12、本發(fā)明實施例具有如下優(yōu)點:

13、本發(fā)明提供的taqman探針實時熒光pcr的探針和引物組合能夠準(zhǔn)確識別克氏原螯蝦的目標(biāo)基因,提高檢測的準(zhǔn)確性和靈敏度,能夠簡化檢測流程,降低檢測成本,為克氏原螯蝦養(yǎng)殖業(yè)的疾病防控和科學(xué)研究提供有力的技術(shù)支持。



技術(shù)特征:

1.一種鑒定克氏原螯蝦taqman實時熒光定量pcr的探針引物組合,其特征在于,包括探針,上游引物和下游引物,所述探針的核苷酸序列為:5'-fam-ctttacctgtgttggca-mgb-3',上游引物的核苷酸序列為5'-gctattaatatacgaacagtagggataacc-3',下游引物的核苷酸序列為5'-caaaaaaagaagtatttagattacgatctg-3'。

2.一種鑒定克氏原螯蝦taqman實時熒光定量pcr的試劑盒,其特征在于,包括如權(quán)利要求1所述的探針引物組合。

3.權(quán)利要求1所述的探針引物組合,或,權(quán)利要求2所述的試劑盒在克氏原螯蝦物種鑒定中的應(yīng)用。

4.一種克氏原螯蝦物種鑒定方法,其特征在于,所述方法包括:

5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的克氏原螯蝦物種鑒定方法,其特征在于,

6.根據(jù)權(quán)利要求4所述的克氏原螯蝦物種鑒定方法,其特征在于,


技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明實施例公開了一種鑒定克氏原螯蝦TaqMan實時熒光定量PCR的探針引物組合、試劑盒及應(yīng)用。包括探針,上游引物和下游引物,所述探針的核苷酸序列為:5'?FAM?CTTTACCTGTGTTGGCA?MGB?3',上游引物的核苷酸序列為5'?GCTATTAATATACGAACAGTAGGGATAACC?3',下游引物的核苷酸序列為5'?CAAAAAAAGAAGTATTTAGATTACGATCTG?3'。本發(fā)明提供的TaqMan探針實時熒光PCR的探針和引物組合能夠準(zhǔn)確識別克氏原螯蝦的目標(biāo)基因,提高檢測的準(zhǔn)確性和靈敏度,能夠簡化檢測流程,降低檢測成本,為克氏原螯蝦養(yǎng)殖業(yè)的疾病防控和科學(xué)研究提供有力的技術(shù)支持。

技術(shù)研發(fā)人員:李維薇,楊春燕
受保護的技術(shù)使用者:中國科學(xué)院昆明動物研究所
技術(shù)研發(fā)日:
技術(shù)公布日:2025/7/28
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